Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AVL9Q8NBF6 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms