Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LMNTD2Q8IXW0 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms