Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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C9orf40Q8IXQ3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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C9orf40Q8IXQ3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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C9orf40Q8IXQ3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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C9orf40Q8IXQ3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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C9orf40Q8IXQ3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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C9orf40Q8IXQ3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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C9orf40Q8IXQ3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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C9orf40Q8IXQ3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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C9orf40Q8IXQ3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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C9orf40Q8IXQ3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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C9orf40Q8IXQ3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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C9orf40Q8IXQ3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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C9orf40Q8IXQ3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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