Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms