Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CCBE1Q6UXH8 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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