Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSSK4Q6SA08 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms