Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q6P435 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Q6P435 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q6P435 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q6P435 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q6P435 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q6P435 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q6P435 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q6P435 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q6P435 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q6P435 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q6P435 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q6P435 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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