Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HMBOX1Q6NT76 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms