Protein–RNA interactions for Protein: Q6ISB3

GRHL2, Grainyhead-like protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL2Q6ISB3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GRHL2Q6ISB3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms