Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms