Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms