Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms