Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms