Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 PDLIM5-210ENST00000508216 1794 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 GGPS1-202ENST00000358966 2740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 RSPH10B2-201ENST00000297186 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 RSPH10B-201ENST00000337579 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC133065.6-201ENST00000625054 2378 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 UGT1A7-201ENST00000373426 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 DDR1-262ENST00000508312 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ANAPC7-201ENST00000450008 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 LINC02362-203ENST00000617323 2044 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 CYTH2-213ENST00000620214 2020 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 CCDC57-205ENST00000392346 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ANKRD39Q53RE8 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms