Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LACTB2Q53H82 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms