Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms