Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5B1Q2VPB7 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms