Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms