Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

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Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ATP6V1FQ16864 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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