Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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PTPROQ16827 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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PTPROQ16827 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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PTPROQ16827 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PTPROQ16827 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPROQ16827 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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