Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIF1AQ16665 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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