Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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SGCAQ16586 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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SGCAQ16586 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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SGCAQ16586 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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SGCAQ16586 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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SGCAQ16586 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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SGCAQ16586 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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SGCAQ16586 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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SGCAQ16586 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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SGCAQ16586 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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SGCAQ16586 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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