Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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RPE65Q16518 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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