Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
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SSX1Q16384 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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SSX1Q16384 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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SSX1Q16384 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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SSX1Q16384 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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SSX1Q16384 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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SSX1Q16384 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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SSX1Q16384 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SSX1Q16384 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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