Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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