Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNGA3Q16281 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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