Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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