Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCN9AQ15858 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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