Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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ALX1Q15699 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALX1Q15699 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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