Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
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