Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERC3Q15034 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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