Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRCAPQ14761 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms