Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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