Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP1A4Q13733 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms