Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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HTR4Q13639 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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HTR4Q13639 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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HTR4Q13639 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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HTR4Q13639 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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HTR4Q13639 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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HTR4Q13639 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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HTR4Q13639 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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