Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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