Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL4BQ13620 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
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