Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ATRQ13535 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ATRQ13535 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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