Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GOLGA4Q13439 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms