Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TCOF1Q13428 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCOF1Q13428 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
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