Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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