Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM28Q13263 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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