Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFT88Q13099 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms