Protein–RNA interactions for Protein: Q12834

CDC20, Cell division cycle protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20Q12834 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDC20Q12834 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms