Protein–RNA interactions for Protein: Q11206

ST3GAL4, CMP-N-acetylneuraminate-beta-galactosamide-alpha-2,3-sialyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST3GAL4Q11206 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ST3GAL4Q11206 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms