Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGNL1Q0VF96 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms