Protein–RNA interactions for Protein: Q0GE19

SLC10A7, Sodium/bile acid cotransporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A7Q0GE19 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A7Q0GE19 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A7Q0GE19 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A7Q0GE19 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A7Q0GE19 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A7Q0GE19 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A7Q0GE19 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A7Q0GE19 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A7Q0GE19 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A7Q0GE19 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A7Q0GE19 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A7Q0GE19 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC10A7Q0GE19 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC10A7Q0GE19 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC10A7Q0GE19 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC10A7Q0GE19 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC10A7Q0GE19 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC10A7Q0GE19 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC10A7Q0GE19 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC10A7Q0GE19 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A7Q0GE19 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms