Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms