Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPAL4Q0D2K0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms