Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CXCL9Q07325 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms